Covid: mutasi yang membuat varian delta virus lebih menular dan lebih mengkhawatirkan
Varian Delta dari coronavirus terdeteksi awalnya di India pada Oktober 2020 dan sejauh ini telah mempengaruhi setidaknya 96 negara. Pada 4 Juli 2021 jumlahnya meningkat menjadi 104. Kazakhstan, Laos, Latvia, Lebanon, Namibia, Oman, dan Sierra Leone adalah negara terbaru yang mengonfirmasi kehadiran varian Delta.
Di beberapa negara ini telah menjadi varian yang dominan, seperti kasus Singapura, Inggris dan Portugal.
Data awal menunjukkan bahwa itu lebih menular daripada varian lain, membawa risiko rawat inap dan infeksi ulang yang lebih tinggi, dan menghasilkan gambaran gejala yang sedikit berbeda (lebih banyak sakit kepala dan lebih sedikit batuk). , misalnya).
Varian delta dari virus SARS-CoV-2 (Covid 19) diperkirakan 30 hingga 60% lebih mudah menular daripada varian lain dari virus corona.
Di Inggris telah menjadi dominan dan menyumbang 90% dari kasus baru.
Varian ini telah menimbulkan kekhawatiran tentang kemungkinan lolos dari perlindungan vaksin, tetapi hipotesis ini belum dikonfirmasi.
Dengan kata lain, penelitian yang dilakukan sejauh ini menunjukkan bahwa vaksin tetap efektif melawan delta.
Di Brasil, kota São Paulo telah mengakui bahwa delta menyebar ke kota, tetapi tidak diketahui sejauh mana atau apakah itu akan menjadi dominan.
Gejala Covid varian Delta
Jika varian India tampaknya lebih menular daripada varian lainnya, itu akan menyebabkan gejala khas Covid-19. Direktur Institut Genomics dan Biologi Integratif di Delhi menunjukkan bahwa pasien menderita:
- sakit kepala,
- hidung tersumbat,
- pilek,
- sakit tenggorokan,
- nyeri otot,
- diare
“Tetap di rumah dan lakukan tes”.
“Varian ini tampaknya bekerja sedikit berbeda,” kata ahli epidemiologi.
“Orang mungkin berpikir bahwa mereka baru saja terkena flu musiman dan mereka terus pergi ke pesta dan bahwa mereka dapat menularkannya kepada orang lain.”
Sebelum munculnya varian Delta, tiga gejala utama Covid-19 adalah demam, kehilangan penciuman dan batuk.
Covid: varian Delta, apa saja gejala dan risikonya sehingga mudah menyebar?
Dan menurut beberapa ahli, mungkin akan segera menjadi varian dominan di dunia.
Sejauh ini, wabah telah dikonfirmasi di Cina, Amerika Serikat, Afrika, Skandinavia, dan negara-negara di pantai Pasifik.
Sebaran
Varian Delta, juga dikenal sebagai B.1.6172, dikenal karena kemampuannya untuk mereplikasi lebih cepat daripada yang lain.
Di Inggris, ahli epidemiologi Neil Ferguson dari Imperial College London mengatakan kepada wartawan pekan lalu bahwa varian tersebut hampir 60% lebih mudah menular daripada varian alfa (B.1.1.7), yang pertama kali terdeteksi di Inggris.
Namun, para ahli menunjukkan bahwa vaksin COVID-19 yang disetujui yang digunakan di Amerika Serikat, Eropa, dan negara-negara lain tampaknya efektif dalam menahan penyebaran varian Delta.
Mungkinkah varian Covid-19 yang semakin berbahaya akan terus muncul atau ada batasnya?
Salah satu alasan utama varian ini menyebar dengan cepat ke seluruh dunia adalah kemampuannya untuk melewati kontrol perbatasan dan tindakan karantina.
Bahkan di Australia, yang menonjol karena kontrol perbatasannya yang ketat, kasus varian Delta telah terdeteksi di Melbourne.
Orang bisa salah mengira gejala flu.
Alasan lain penyebarannya adalah pelonggaran pembatasan dan fakta bahwa orang “lelah” dengan jarak sosial.
Selain itu, para ahli mencatat, varian Delta menunjukkan gejala berbeda yang dapat dengan mudah disalahartikan sebagai pilek.
Tapi apa yang membuat varian delta ini lebih mengganggu?
Secara umum, ini adalah kumpulan “peningkatan” genetik yang memfasilitasi penyebaran dan invasi ke tubuh manusia.
Namun isu lingkungan yang dipertaruhkan tidak boleh kita abaikan, yakni bagaimana perilaku masyarakat tanpa tindakan pengendalian dan pencegahan turut mempengaruhi penularan varian tersebut.
Mutasi “menguntungkan” untuk virus corona
Sars-CoV-2, virus corona penyebab penyakit covid-19, tidak mampu bermutasi seperti virus influenza, misalnya.
Tetapi ketika varian baru muncul, mereka harus menunjukkan karakteristik “menguntungkan” yang membuat mereka bertahan dalam lingkungan di mana persaingan dan seleksi sedemikian rupa sehingga mereka dapat menyerang tubuh manusia.
Dalam presentasi varian delta kepada pemerintah Afrika Selatan, ahli bioinformatika Tulio de Oliveira, direktur laboratorium Krisp di Universitas KwaZulu-Natal, Afrika Selatan, mencantumkan karakteristik utama varian delta.
Hal ini lebih menular dan lebih mungkin untuk menginfeksi kembali orang yang sebelumnya pernah sakit dengan jenis lain, tetapi belum jelas apakah jenis delta menyebabkan penyakit yang lebih serius atau jika lolos dari perlindungan yang ditawarkan oleh vaksin.
Bisakah saya terkena virus corona dua kali?
Gejala virus corona ‘terlihat setelah lima hari’
Oliveira juga mencantumkan tiga kelompok mutasi varian delta yang relevan:
Dua substitusi dalam domain pengikatan reseptor sel (L452R dan T478K).
substitusi dekat situs pembelahan S1 / S2 oleh furin (P681R)
substitusi (T19R) dan penghapusan (157-158del) dalam domain antigen NTD.
Tapi apa yang diwakili semua ini? Mari kita lihat masing-masing.
1. Invasi sel yang lebih efisien
Sebagian besar dari perubahan “menguntungkan” ini terjadi dalam cara virus terhubung ke sel kita.
Secara khusus, hubungan antara lonjakan virus (juga dikenal sebagai protein S) dan reseptor ACE2, enzim yang ditemukan di permukaan sel kita.
Lonjakan ini bertindak seolah-olah itu adalah kunci yang membuka kunci di sel kita dan memungkinkan virus corona menyerangnya.
Begitu masuk, ia menggunakan struktur seluler untuk berkembang biak.
Dalam kasus varian delta, ada dua mutasi yang relevan pada tongkolnya, yang dikenal sebagai L452R dan T478K.
Tapi apa arti angka dan huruf ini? Huruf pertama adalah jenis asam amino yang ada sebelum perubahan (L, simbol untuk lisin), nomornya adalah lokasi (ke-452 dari 1273 asam amino) dan huruf terakhir adalah asam amino yang berasal dari tempatnya (R, simbol untuk arginin).
Selama proses produksi virus ini, asam amino di sekitarnya dapat mengalami tiga jenis mutasi: penghapusan (deletion), penyisipan (insertion) atau perubahan (substitusi).
Mutasi ini tidak terjadi karena alasan tertentu dan sering hilang di tengah jalan.
Tetapi beberapa dari mereka menjadi mapan dan mulai muncul segera setelah virus bereplikasi.
Ini adalah kasus untuk dua mutasi delta kunci: L452R dan T478K.
Perubahan dari L ke R pada posisi 452 dan perubahan dari T ke K pada posisi 478 ditemukan “menguntungkan” bagi virus karena memungkinkan penyerbu untuk menempel lebih baik pada portal masuk (enzim ACE2).
Ini menjelaskan mengapa varian ini menjadi lebih menular.
Selain invasi yang lebih efisien, ada kecenderungan bahwa semakin banyak virus yang menyerang sel, semakin banyak mereka bereplikasi, yang meningkatkan viral load.
Karena itu, lebih banyak virus akan ditularkan melalui batuk atau bersin, misalnya.
Sebuah studi oleh para peneliti dari Centers for Disease Control and Prevention of China menemukan bahwa seseorang yang terinfeksi varian delta dapat memiliki hingga 1.000 kali lebih banyak virus di dalam tubuhnya daripada orang yang terinfeksi virus corona versi sebelumnya. pandemi di penghujung tahun 2019.
Viral load yang lebih tinggi ini juga dapat dikaitkan dengan tingkat keparahan penyakit yang lebih besar, karena varian tersebut cenderung mempengaruhi lebih banyak sel pernapasan manusia.
2. Aktivasi dan teori penciptaan virus corona yang lebih efisien di laboratorium.
Untuk menyerang sel manusia, tidak cukup bagi virus untuk menemukan pintu gerbang dan menempelkannya: ia harus diaktifkan terlebih dahulu.
Dalam kasus Sars-CoV-2, aktivasi ini terjadi melalui enzim dalam tubuh manusia (disebut furin) yang memotong ujung virus corona menjadi dua: S1 dan S2.
Setelah pemotongan ini, yang disebut pembelahan, bagian dari telinga (S1) menempel pada sel manusia dan yang lainnya (S2) menggabungkan membrannya dengan sel manusia, memungkinkan penyisipan materi genetik dan memulai produksi lebih banyak virus.
Dengan memotong tongkolnya, enzim menyebabkannya terbuka dan mengungkapkan urutan genetik tersembunyi yang membantunya mengikat lebih erat ke sel-sel di saluran udara manusia, misalnya.
Mutasi di dekat lokasi ini selanjutnya dapat mengubah perilaku ini.
Demikian halnya dengan varian delta, yang membawa mutasi (P681R) di wilayah ini.
“Semakin sensitif manusia terhadap furin, semakin efisien puncak virus. Proses fusi yang diaktifkan furin ini dimediasi oleh area dari posisi asam amino 618 ke posisi asam amino 1273” , jelas ahli virologi José Eduardo Levi, penelitian dan pengembangan koordinator jaringan laboratorium Dasa dan peneliti di Institute of Tropical Medicine di University of São Paulo (USP).
“Mutasi di wilayah ini, seperti P681R, membuat fusi ini lebih cepat. Mutasi ini muncul pada varian delta dan alfa, ditemukan di Inggris, dan dalam beberapa kasus pada varian gamma, ditemukan di Brasil,” tambahnya. .
Mutasi di wilayah virus corona ini sangat penting sehingga menjadi jantung dari dua titik fokus pandemi.
Pertama, afinitas terhadap furin manusia ini akan sangat penting dalam memungkinkan virus untuk melarikan diri dari spesies hewan lain dan mulai menginfeksi manusia pada akhir 2019.
Kedua, mekanisme ini sangat efisien dan atipikal di antara jenis virus corona yang menginfeksi manusia sehingga menjadi argumen utama bagi mereka yang mengklaim tanpa bukti bahwa Sars-CoV-2 dihasilkan atau dimodifikasi di laboratorium.
“Semua virus corona yang menginfeksi manusia memiliki domain tertentu, area spesifik yang mengenali furin,” kata Levi.
“Tetapi Sars-CoV-2 sangat manusiawi. Dengan kata lain, ini jauh lebih efektif daripada apa yang telah diamati pada virus corona lain, yang memiliki pengenalan furin yang masuk akal.”
“Dan hanya Sars-CoV-2 yang memiliki mutasi ini, penyisipan empat asam amino ini. Ini adalah argumen terkuat untuk mengatakan bahwa virus corona ini dibuat di laboratorium.”
“Karena sejauh ini belum ditemukan virus corona intermediate, yang menandakan sudah membaik secara bertahap. Ia sudah sampai siap untuk disegmentasi oleh furin manusia,” tambah ilmuwan tersebut.
Menurut pakar, tidak adanya urutan empat asam amino ini pada virus corona Sars-CoV dapat menjelaskan mengapa hal itu menyebabkan wabah Sars terbatas di Asia pada tahun 2003, yang tidak berubah menjadi pandemi yang menyebar ke seluruh dunia sebagai Sars-CoV. -2.
3. Sebagian lolos dari antibodi dan vaksin
Fernando Spilki, profesor di Universitas Feevale dan koordinator jaringan Corona-Ômica di Kementerian Sains, Teknologi, dan Inovasi Brasil, menggunakan analogi bagian Lego untuk menjelaskan peran mutasi dalam kemungkinan varian lolos dari sistem kekebalan dan vaksin.
Untuk mempelajari cara mempertahankan diri, sel pertahanan, seperti antibodi penetralisir, menggunakan bagian dari penyerang untuk belajar mengidentifikasi dan melawan mereka.
Ketika mutasi terjadi pada virus corona, misalnya, seolah-olah bagian dari antibodi tidak lagi cocok dengan bagian penyerang, membuatnya lebih mudah lolos.
Oleh karena itu, pada saat yang sama, virus dapat bermutasi untuk menempelkan dirinya secara lebih efektif ke pintu masuk sel dan sebagian lolos dari ikatan antibodi penetral.
Bagi Spilki, “seolah-olah virus telah menciptakan jalur untuk keluar dari sistem kekebalan dan mengembangkan cara penularan yang lebih efisien.”
Dia menjelaskan bahwa semua perubahan ini “diprediksi” dalam eksperimen laboratorium, yang mampu menganalisis pengaruh setiap pertukaran, penyisipan, atau penghapusan potongan-potongan kecil ini pada perilaku virus corona.
Dalam kasus varian delta, mutasi yang terkait dengannya adalah substitusi T19R dan penghapusan 157-158del.
Kembali ke analogi potongan Lego, substitusi asam amino T (treonin) oleh R (arginin) di posisi 19 membuat sulit untuk mengidentifikasi penyerang oleh sistem pertahanan tubuh dan perjuangannya.
Hal yang sama berlaku untuk asam amino yang “hilang” pada posisi 157 dan 158.
Biasanya protein memiliki dua ujung, satu disebut ujung-N dan ujung-C lainnya.
Dalam kasus coronavirus, wilayah terminal-N (NTD) dianggap lebih antigenik atau imunogenik.
Dengan kata lain, sistem pertahanan manusia “mendeteksi” lebih baik dan menghasilkan lebih banyak antibodi untuk melawannya.
Ujung (protein S) adalah yang paling antigenik, jadi vaksin biasanya diproduksi dengan menargetkan struktur ini untuk mengajari sistem pertahanan tubuh mengidentifikasinya guna melawan virus corona secara keseluruhan.
Di sinilah mutasi masuk sebagai cara untuk menghambat perang melawan virus corona.
Modifikasi (penghapusan dan substitusi) struktur varian delta di zona antigenik (DTN) menyulitkan sistem pertahanan tubuh untuk bertindak.
“Kenapa dia mulai menghilangkan bagian genomnya? Pasti ada alasan kuat untuk itu. Apa? Respon imun manusia, apakah alami dari infeksi atau diinduksi oleh vaksin,” kata Levi.
“Umumnya penghapusan itu merugikan, yaitu membuat virus tidak efektif dan berakhir membunuhnya. Tetapi dalam kasus varian coronavirus, penghapusan ini menguntungkan karena menghilangkan daerah yang menyebabkan respons imun yang sangat kuat di inang. dan dengan demikian berhasil melarikan diri (sistem pertahanan manusia), “tambahnya.
Sejauh ini, telah terbukti bahwa varian delta dapat lolos dari antibodi orang yang telah terinfeksi varian beta (ditemukan di Afrika Selatan).
Tetapi belum ada yang membuktikan bahwa ia mampu lolos dari respons imun yang dihasilkan oleh vaksin.
Harus diingat bahwa tidak satu pun dari mutasi ini khusus untuk satu atau yang lain dari varian. Yang membuat mereka khawatir adalah kombinasi mereka.
Artinya, mereka pada saat yang sama memiliki karakteristik baru yang membuat mereka lebih baik dalam menyerang sel, lebih efektif dalam mengaktifkan dan melarikan diri dari sistem pertahanan.
Menurut Levi, latar belakang beberapa varian yang memiliki mutasi acak yang relatif sama disebut konvergensi evolusioner.
Memang, di antara alasan lain, tekanan evolusioner seleksi alam terhadap bentuk paling beragam dari virus corona di seluruh dunia hampir sama: orang memperoleh kekebalan, baik melalui vaksin atau karena mereka telah terinfeksi virus tersebut.
Penyakit dari A-Z & Daftar Lengkap, Nama, Jenis, Contoh
Nama Obat dan Untuk Penyakit Apa ? – Daftar Nama Obat Esensial diterbitkan oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO)
Sumber bacaan: Cleverly Smart, Aljazeera, NYmag, BBC, The Conversation, Web MD, Imperial College London
Sumber foto: Kicknews
Informasi: Pinter Pandai bukan sebagai pengganti Dokter. Jika Anda memiliki tanda-tanda atau gejala-gejala di atas atau pertanyaan lainnya, konsultasikanlah dengan dokter Anda. Tubuh masing-masing orang / individu berbeda. Selalu konsultasikan ke Dokter untuk menangani kondisi kesehatan Anda.
Unduh / Download Aplikasi HP Pinter Pandai
Respons “Ooo begitu ya…” akan lebih sering terdengar jika Anda mengunduh aplikasi kita!
Siapa bilang mau pintar harus bayar? Aplikasi Ilmu pengetahuan dan informasi yang membuat Anda menjadi lebih smart!
Pinter Pandai “Bersama-Sama Berbagi Ilmu”
Quiz | Matematika | IPA | Geografi & Sejarah | Info Unik | Lainnya | Business & Marketing
